Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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