Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRHP20396 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRHP20396 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRHP20396 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRHP20396 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRHP20396 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRHP20396 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRHP20396 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 PSORS1C2-201ENST00000259845 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRHP20396 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC007378.1-201ENST00000609765 478 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRHP20396 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 VTI1BP2-201ENST00000394154 696 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 TSEN15P3-201ENST00000422363 367 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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