Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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