Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms