Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm20834J3QM72 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20834J3QM72 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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