Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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H2-Eb1P04230 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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H2-Eb1P04230 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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