Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms