Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms