Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PARP3Q9Y6F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms