Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4BQ9Y4P1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4BQ9Y4P1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4BQ9Y4P1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms