Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNOT7Q9UIV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNOT7Q9UIV1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms