Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trex2Q9R1A9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms