Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GGA3Q9NZ52 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms