Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN3Q9NQT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms