Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL3Q9NQ33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms