Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM60Q9H2L4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM60Q9H2L4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms