Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tvp23bQ9D8T4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms