Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY4Q9C004 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms