Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms