Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms