Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EpcamQ99JW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EpcamQ99JW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms