Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMD11Q96NU1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms