Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A4AQ96JQ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A4AQ96JQ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms