Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHDQ96IW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms