Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL4Q96C24 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYTL4Q96C24 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms