Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf2Q921K8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcaf2Q921K8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf2Q921K8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms