Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zcchc4Q8BKW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms