Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TwistnbQ78WZ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwistnbQ78WZ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms