Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vma21Q78T54 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vma21Q78T54 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms