Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A3Q6PIS1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms