Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a2Q6PIE5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a2Q6PIE5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1a2Q6PIE5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms