Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp49Q6P9L4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms