Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp1Q62209 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms