Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrkQ60976 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrkQ60976 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
JrkQ60976 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms