Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HES3Q5TGS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms