Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMPD3Q5JV73 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD3Q5JV73 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms