Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP6Q16828 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP6Q16828 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms