Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR4Q13639 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms