Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	COA3	YJL062W-A	258 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	GRE1	YPL223C	507 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YBR139W	YBR139W	1527 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	ATG26	YLR189C	3597 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	PMT5	YDL093W	2232 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	KIN2	YLR096W	3444 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YCR085W	YCR085W	354 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	LUC7	YDL087C	786 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	MHF2	YDL160C-A	243 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	ESF1	YDR365C	1887 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	ADY3	YDL239C	2373 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	GIP2	YER054C	1647 nt		4.9	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	CNL1	YDR357C	369 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	SNA2	YDR525W-A	240 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	RPL28	YGL103W	450 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	TAF11	YML015C	1041 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	AST1	YBL069W	1290 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	FKH2	YNL068C	2589 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	STP4	YDL048C	1473 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	AUA1	YFL010W-A	285 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	SYP1	YCR030C	2613 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	KCC4	YCL024W	3114 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	TPS3	YMR261C	3165 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	HST4	YDR191W	1113 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	ECT1	YGR007W	972 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	ROT1	YMR200W	771 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	TOM40	YMR203W	1164 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	RRP40	YOL142W	723 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	YPR059C	YPR059C	387 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	QCR2	YPR191W	1107 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	MNN4	YKL201C	3537 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	AIM7	YDR063W	450 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	ARG82	YDR173C	1068 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	FMP46	YKR049C	402 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	MED4	YOR174W	855 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	YHR182W	YHR182W	2358 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	IFM1	YOL023W	2031 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	RSC6	YCR052W	1452 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	MRE11	YMR224C	2079 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	THS1	YIL078W	2205 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	PHM7	YOL084W	2976 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	AIM21	YIR003W	2040 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	YIL028W	YIL028W	399 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	YJR096W	YJR096W	849 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	MRPL3	YMR024W	1173 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	MAK3	YPR051W	531 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	NTA1	YJR062C	1374 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	SLD2	YKL108W	1362 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	RRB1	YMR131C	1536 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	MTR10	YOR160W	2919 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	PRM7	YDL039C	2097 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	GCR1	YPL075W	2358 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	HUL4	YJR036C	2679 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	COX4	YGL187C	468 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	snR17b	snR17b	332 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	PZF1	YPR186C	1290 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	NOC4	YPR144C	1659 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	YJL206C	YJL206C	2277 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	ARH1	YDR376W	1482 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	CPR1	YDR155C	489 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	YKR104W	YKR104W	921 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	MAC1	YMR021C	1254 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY3A-G	Q12173	SSB2	YNL209W	1842 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	ADE6	YGR061C	4077 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	IML2	YJL082W	2196 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	GCV1	YDR019C	1203 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	NKP2	YLR315W	462 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	GTR1	YML121W	933 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	RSF1	YMR030W	1131 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YHR177W	YHR177W	1362 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YFR035C	YFR035C	345 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YKL169C	YKL169C	384 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	MRP21	YBL090W	534 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YOR292C	YOR292C	930 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	CDC28	YBR160W	897 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	AXL2	YIL140W	2472 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	RTT103	YDR289C	1230 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YEL067C	YEL067C	588 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	YNL194C	YNL194C	906 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	MSC2	YDR205W	2175 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	RCK2	YLR248W	1833 nt		4.81	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	RKM2	YDR198C	1440 nt		4.8	□□□□□ -1.64
TY3A-G	Q12173	TSL1	YML100W	3297 nt		4.8	□□□□□ -1.64

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