Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDR1Q08345 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDR1Q08345 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms