Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms