Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 UTP11YKL099C 753 nt5.1□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 AST1YBL069W 1290 nt5.1□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 MET7YOR241W 1647 nt5.1□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 PXA1YPL147W 2613 nt5.1□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 GRE1YPL223C 507 nt5.1□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 YPL245WYPL245W 1365 nt5.09□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 API2YDR525W 330 nt5.09□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 MRPL3YMR024W 1173 nt5.09□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 RET3YPL010W 570 nt5.09□□□□□ -1.59
UBX2Q04228 SKG3YLR187W 3081 nt5.08□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 NUP42YDR192C 1293 nt5.08□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 HNT2YDR305C 654 nt5.08□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YHL049CYHL049C 816 nt5.08□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SPC105YGL093W 2754 nt5.08□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 CWH43YCR017C 2862 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 VID22YLR373C 2706 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 MSK1YNL073W 1731 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 RNA15YGL044C 891 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 CDC12YHR107C 1224 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 THI20YOL055C 1656 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YMR221CYMR221C 1515 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 ESF1YDR365C 1887 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 ARN2YHL047C 1863 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 ARO80YDR421W 2853 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 AFT1YGL071W 2073 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 MPS3YJL019W 2049 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 BUD25YER014C-A 462 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 NTR2YKR022C 969 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 BUD17YNR027W 954 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 FLC1YPL221W 2382 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 MTR10YOR160W 2919 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 ATH1YPR026W 3636 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SPC97YHR172W 2472 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 NTA1YJR062C 1374 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 FAA3YIL009W 2085 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SRG1SRG1 551 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 RCR2YDR003W 633 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 TAF11YML015C 1041 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 VPS68YOL129W 555 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 HAL1YPR005C 885 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YCR023CYCR023C 1836 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 PRP28YDR243C 1767 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 BOP2YLR267W 1713 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 URA7YBL039C 1740 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 STR2YJR130C 1920 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 PEX7YDR142C 1128 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 TFB3YDR460W 966 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YFL068WYFL068W 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 ECM2YBR065C 1095 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 RIA1YNL163C 3333 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SNF3YDL194W 2655 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 TRM11YOL124C 1302 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YDL228CYDL228C 642 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 SUR2YDR297W 1050 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YGR016WYGR016W 573 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 MIC26YGR235C 702 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 KRE9YJL174W 831 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YJR038CYJR038C 363 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 MID2YLR332W 1131 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 JHD2YJR119C 2187 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YLH47YPR125W 1365 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX2Q04228 YIL001WYIL001W 1542 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX2Q04228 YPL260WYPL260W 1656 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX2Q04228 RIP1YEL024W 648 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX2Q04228 YEL045CYEL045C 426 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX2Q04228 SPO19YPL130W 672 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX2Q04228 MET17YLR303W 1335 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX2Q04228 YCR085WYCR085W 354 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX2Q04228 IRC22YEL001C 678 nt5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms