Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cacna1cQ01815 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cacna1cQ01815 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms