Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms