Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps25P62852 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps25P62852 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps25P62852 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps25P62852 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps25P62852 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms