Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf5P56477 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf5P56477 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf5P56477 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf5P56477 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf5P56477 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms