Protein–RNA interactions for Protein: P56135

Atp5j2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5j2P56135 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5j2P56135 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5j2P56135 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms