Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL23P55773 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL23P55773 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL23P55773 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL23P55773 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL23P55773 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL23P55773 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL23P55773 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL23P55773 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL23P55773 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL23P55773 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL23P55773 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL23P55773 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL23P55773 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL23P55773 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL23P55773 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL23P55773 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL23P55773 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL23P55773 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms