Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsgP28293 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsgP28293 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms