Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja1P23242 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja1P23242 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja1P23242 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gja1P23242 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms